全国校园足球特色学校的经费主要来源于教育部的财政拨款，各地教育行政部门的拨款，以及国家体育总局的资金支持。此外，学校也可以从社会组织和企业拿到志愿捐款，以及社会上的其他支持。
教育部的财政拨款主要包括校内足球特色学校设立费、体育设施改造费和教学费用等，以及政府安排的其他费用。各地教育行政部门的拨款，一般是按照学校、学生人数、学校设施、足球特色学校的设置等综合考虑情况，拨款数额也不尽相同。国家体育总局的资金支持主要是为足球特色学校提供训练设施、教育资源、财政补贴等。
志愿捐款是指社会组织和企业向足球特色学校提供的资金支持，一般不以经济报酬为目的，而是以支持足球特色学校发展为目的。此外，社会上还有很多形式的支持，包括个人捐赠、足球特色学校募捐活动等，都可以为足球特色学校提供一定的资金支持。
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