1、巨细胞病毒感染的治疗方案主要是抗病毒治疗，首选的药物是 更昔洛韦，疗程在2-4周左右。对于免疫缺陷的患者，疗程需要延长，在治疗的过程中需要注意监测药物的不良反应，最常见的不良反应有白细胞、血小板的减少以及肝功能损害等等。当然也可以使用其他的抗病毒药物，如膦甲酸钠、阿昔洛韦等等。
2、对于巨细胞病毒感染的预后，主要还是取决于年龄以及是否有正常的免疫状。对于大多数的成人及儿童，即使不治疗，也具有自限性。对于孕妇，如果是孕早期感染，那么需要尽快的终止妊娠；如果是在妊娠的中晚期感染，需要检查胎儿有无畸形，再作相关的处理。
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