氨基酸是构成蛋白质的基本单位，根据其侧链基团的不同性质和化学反应特性，可以将氨基酸分为五大类：非极性脂肪族氨基酸、极性中性氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸以及芳香族氨基酸。
非极性脂肪族氨基酸的侧链是饱和或不饱和的碳氢链，这类氨基酸包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸等。它们在水中的溶解度较低，通常位于蛋白质分子内部，参与维持蛋白质的二级结构如α-螺旋和β-折叠。
极性中性氨基酸的侧链含有可极化的官能团，但不带电荷，如丝氨酸、苏氨酸等。这些氨基酸对水有中等程度的亲和力，常位于蛋白质表面，有助于形成氢键，增强蛋白质与水或其他极性分子的相互作用。
酸性氨基酸包括天冬氨酸和谷氨酸，它们的侧链带有羧基，使得这些氨基酸在生理pH下带负电。这类氨基酸通常位于蛋白质表面，参与蛋白质与其他分子之间的静电相互作用。
碱性氨基酸如赖氨酸、精氨酸和组氨酸，侧链含有可解离的氨基，使这些氨基酸在生理pH下带正电。它们通常位于蛋白质表面，参与蛋白质与核酸、多糖等大分子的相互作用。
最后，芳香族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸，它们的侧链含有苯环结构，赋予了蛋白质特定的光谱性质和疏水性。这类氨基酸通常位于蛋白质内部，参与蛋白质的三维结构稳定。